Группа Surgical Dissection была основана в сентябре 1993 года в городе Банска Быстрица (Словакия) в изначальный состав вошли: Robert Kmet - вокал, Jan Cief - гитара, Michal Molnar - ударные, Jan Jambrich - бас-гитара, Martin Majer - гитара. В самом начале их музыка походила на классический death metal с некоторыми элементами grindcore. Летом 1996 Robert Kmet покинул группу, через месяц для создания совместного проекта за ним последовал Jan Сief. В таком составе группа просуществовала ещё три месяца пока Marek "Later" Barto (экс-Anorexia, R.I.P. ) не стал их новым вокалистом.

В марте 1997 в полном составе записывают свой первый официальный демо-альбом "Dehumanized". Запись производилась 22-23 марта 1997 в студии PEBA, город Слиач (Словакия). Демо-альбом содержал интро и 6 песен (примерно на 20 минут). Группа обозначила свой стиль как Grinding Brutal Core. Демо-альбом в количестве 250 копий разошёлся по чешской и словацкой андеграундной тусовке, некоторое количество также попало за границу. Публикой демо-альбом был принят превосходно, и группа дала серию концертов в Словакии при участии возвратившегося осенью 1997 гитариста Jan Cief.

В течение следующего года в дополнение к концертной деятельности группа готовит новый материал. Запись проходила в марте 1999 года на студии Exponent в городе Глоговец (Западная Словакия). Новый полноформатный альбом под названием "The Inborn Malignance" выходит на андеграундном лейбле Erebos Рroductions, после чего вскоре альбом получает положительные отзывы почти со всего мира. В начале мая 2000 года группу покидает вокалист Marek "Later" Barto, но к концу мая удаётся найти замену в лице Ivan Frost. С ним группа выступает на пятом фестивале Brutal Assault в чешском городе Бланско, где делят сцену с Mortician, Malignancy и Macabre.

В июне 2001 года группа на студии Moonset подготавливает мини-альбом "Promo 2001", в который вошли три новых песни. Этот альбом предназначался в основном для издателей, но несколько копий всё же попали в некоторые фанзины и получили довольно хорошие отзывы. Промо было отправлено в несколько издательств в Словакии и Чехии. Группой вскоре заинтересовалась словацкая контора Immortal Souls Productions и в начале 2002 года запустила для группы веб-сайт www.slovanet.sk/surgicaldissection.sk, который находился в английском варианте и содержал всю информацию о группе.

В марте 2002 года группа вновь возвращается в студию Moonset, чтобы записать новый полноформатный альбом "Absurd Humanism", в котором содержалось 8 песен, и был дополнен треками из первого демо "Dehumanized". Этот альбом в течение 2002 года выходит на Immortal Souls Productions. Но летом 2002 сотрудничество между группой и лейблом преждевременно заканчивается, группа остаётся без издателя и решает выпустить диск за свой счёт.

В апреле 2003 года группа наконец запускает свой собственный сайт www.surgicaldissection.sk. В то же время поступает предложение от чешской группы Fleshless опубликовать альбом "Absurd Humanism" на Nice To Eat You Records, который выходит компакт-диском в середине мая 2003 года, после этого группа начинает давать концерты в Германии и Чехии. Отыгрывает на нескольких летних фестивалях, в том числе и на Brutal Assault. Меньше чем за год альбом "Absurd Humanism" расходится по всему миру. Скопировано с Dark-World.ru. В конце 2003 года группа получает приглашение от Nice To Eat You Records принять участие в европейском турне Sensual Death Immitation Tour 2004, в котором помимо них должны были принять участие Fleshless, Deception и Gomorrha.

Но незадолго до этого Gomorrha отказывается от участия, и Surgical Dissection приходят им на замену. Группы Laniena Mentis и поляки Deception вскоре после начала тура отказываются от дальнейших выступлений, но это не помешало продолжать тур. Сам тур начался 16 апреля в немецком городе Лобау, далее посетили Роттердам, бельгийский Гент. Потом последовали выступления в итальянских городах Брешия и Модена, также состоялись гастроли в швейцарском городе Зофинген. Закончился тур 24 апреля в маленьком немецком городке Вахенрот. Тур прошёл без проблем и имел большое значение для группы.

Далее коллектив вновь начинает сотрудничать с Nice To Eat You Records, чтобы начать готовить новый материал, получив контракт на долговременное сотрудничество, группа отправляется в Моравию на студию Shaark, где с сентября до середины октября 2005 готовит полноформатный альбом "Disgust". Вскоре после выхода релиза, группа получает ещё больше положительных откликов и Surgical Dissection начинает гастролировать в поддержку этого альбома. Осенью 2006 года коллектив покидает бас-гитарист Jan Jambrich и группа продолжает свои концерты вчетвером.

После концертов в мае и июне 2007 года Ntey Records подготавливает для группы 10-дневное европейское турне совместно с американской группой Aversion To Life по Чехии, Германии, Австрии, Швейцарии и Словакии. Группа Aversion To Life в последнюю минуту отказывается от участия, потому что некоторые её участники не смогли приехать в Европу. В итоге Surgical Dissection отправляются в этот тур вместе с Mucopus, Fleshless, Miasma, Sadistic Brainslaughter, Inhume. Следующий год был достаточно спокойным для группы и в связи с занятостью членов команды участия в концертах стали меньше.

2008 год принёс команде и дополнительные изменения:, так, по взаимному согласию в марте коллектив покинул вокалист Ivan Frost. В апреле вернулся бас-гитарист Jan Jambrich, и дальнейшая подготовка нового материала проходила без вокалиста. Но ожидания наконец окупились, и в конце апреля 2009 года приходит новый вокалист Marek "Fajo" Falat. С ним группа стала готовить новую концертную программу и новые песни для следующего альбома. Осенью 2011 года коллектив вновь вернулся в студию Shaark, чтобы записать новый альбом получивший название "Origin And Intention". Но работа над альбомом затягивается из-за частых гастролей и выход нового альбома откладывается на 2013 год.