Nekrokrist SS был сформирован в 2000 году в Финляндии. Изначально группа состояла из двух человек: Nekroführer - вокал, гитара, бас, и Nekrokommando - ударные. Затем ударник покинул проект и Nekroführer'ом был набран полноценный состав, который остается неизменным по сей день.

Nekrokrist SS не относятся к группам жанра NS Black Metal, как многие могут подумать, исходя из названия. Их творчество воспевает смерть, геноцид и пытки, саморазрушение и презрение ко всему живому.

В 2003 году группа в составе двух человек записала первое демо. Звучание вышло довольно сырым и шумным. Присутствие песни "Chamber 88", псевдонимы участников и аббревиатура "SS" в названии группы и положили начало ошибочному суждению о том, что Nekrokrist SS является представителем NSBM-жанра. Но как сказал Nekroführer в одном из интервью, группа даже не планировалась как NSBM-проект.

В 2007 году в новом составе группа выпускает выпустила первый полноформатный альбом под названием "Suicide". Тематика альбома, в основном, посвящена презрению к современному миру и самоуничтожению. Звучание стало заметно качественней и в нем начала выделяться некоторая особенность, выделяющая группу на фоне остальных блэк-метал-проектов.

В периоде с 2009 по 2012 были выпущены один мини-альбом и три сплита с такими командами, как Mystes, Khaos Abyssi, Calvarium Funestus, Nattfog, Faagrim. Сплит с последними выделяется небольшим уклоном в сторону NSBM, названием "Strike Of The Northern Legions" и самолетами "Messerschmitt Stuka" на обложке. Но это только обложка, тематика и звучание остались неизменными, даже более каноничными чем в предыдущих работах.

11 сентября 2013 года на Primitive Reaction вышел второй полноформатный альбом Nekrokrist SS под названием "Der Todesking". В конце сентября 2014 на Hammer of Hate Records вышел сплит с Förgjord. Скопировано с Dark-World.ru. Материал получился достойным, группы звучат в своей фирменной стилистике: Förgjord - мрачно и угнетающе, Nekrokrist SS - атмосферно и воинствующее.

В июле 2016 года на кассетах тиражом в 100 копий был выпущен сплит-альбом с итальянской группой Infamous посредством Hammerbund.