Музыкальный коллектив Marduk был основан в 1990 году Morgan Steinmeyer Håkansson и тогда носил название God. В сентябре того же года название группы было сменено на нынешнее, кроме того к группе вскоре примкнул второй участник Joakim Göthberg, более известный под псевдонимом Af Gravf.

В 1991 году готов уже первый музыкальный материал в виде демозаписи, вышедшей в 11 июня. Демо получило богохульное название "Fuck Me Jesus" и разошлось тиражом более 1000 экземпляров.
Кроме того, демо, в большинстве своём, было хорошо принято критиками. В записи демо приняли участие Morgan Steinmeyer Håkansson - гитара, Af Gravf - ударные, Rickard Kalm - бас и Andreas Axelsoon - вокал. В 1992 году был подписан договор с лейблом No Fashion Records, и в конце 1992 года вышел дебютный альбом группы под названием "Dark Endless". К этому моменту в группу пришёл второй гитарист Devo Andersson, а также сменился басист на Bogge Svensson.

Альбом распространялся довольно плохо, почти не рекламировался, к тому же выход его был задержан. В итоге Marduk перебрались на новый лейбл Osmose Productions. Вскоре последовали очередные смены состава: из-за ухода вокалиста петь пришлось ударнику Af Gravf (настоящее имя Joakim Gothberg, позже организовал проект Dimension Zero с бывшими гитаристами In Flames - Jesper Stromblad и Glenn Ljungstrom).

В 1993 году выходит второй альбом группы под названием "Those of the Unlight", который был записан в студии Unisound Studio вместе с Даном Сванё. Альбом заслужил множество высоких оценок. В конце года группа совершила турне по родной Швеции. Весной 1994 года Marduk начинают запись третьего альбома, летом вместе с Immortal участвуют в туре по странам Европы. В конце 1994 года наконец выходит "Opus Nocturne", а в группе опять меняется состав: уходит второй гитарист Devo Andersson, Af Gravf стал вокалистом, а место барабанщика занял Frederik Andersson. Также под конец года лейблом Osmose Productions переиздаётся первое демо "Fuck Me Jesus" с добавлением двух композиций: "Intro" и "Outro". В поддержку переиздания, были выпущены футболки с изображением обложки демозаписи.

В 1995 году выходит сборник композиций в стиле блэк-метал, среди прочих на который вошла композиция "Autumnal Reaper" с альбома "Opus Nocturne". В этом году группа претерпевала большие проблемы с лейблом и составом: на смену ушедшему Af Gravf явился Legion. В 1996 году наконец выходит очередной альбом — "Heaven Shall Burn... When We Are Gathered". Альбом отличался очень высокой скоростью и качественной работой нового вокалиста.

В этом же году выходит EP "Glorification", на который вошли ремикс композиции "Glorification of the Black God", а также кавер-версии композиций групп Destruction, Piledriver и Bathory. В 1997 году последовали многочисленные концерты, в основном по странам Европы, что явилось причиной записи и выпуска первого концертного альбома группы "Live in Germania". Во время концертов в роли второго гитариста выступал Петер Тэгтгрен из Hypocrisy. В мае 1998 года вышел "Nightwing", отличающийся более ровным и менее скоростным звучанием.

Альбом 1998 года "Nightwing" концептуальный, о жизни Влада III Цепеша, более известного как Граф Дракула.
Тема Второй мировой войны и Третьего рейха используется с 1999 года (альбом "Panzer Division Marduk"). Интерес к этой теме достаточно быстро рос среди фэнов Marduk, группа выпускала всё больше и больше песен, посвященных тёмным, но захватывающим главам человеческой истории. Например: "The Hangman of Prague" (кличка пражского "рейхспротектора" Рейнхарда Гейдриха), "Night of the Long Knives" (Ночь длинных ножей), "Deathmarch" и другие. Но надо отметить, что Marduk, поющие о нацистской Германии, не относят себя к представителям NSBM и не одобряют её восхваления или оправдания.

В 1999 году группа отправляется в студию для записи нового полноформатника "Panzer Division Marduk". Также музыканты отправляются в турне по странам Скандинавии, в Грецию и Японию, а летом Marduk участвуют в фестивалях. На Dynamo группа стала хедлайнером блековой сцены. В этом же году проходит запись мини-альбома "Obedience", после чего Marduk отправляются в семинедельный тур.

В 2000 году "Obedience" выходит в свет на собственном лейбле группы Blooddawn Productions. Весной группа присоединяется к Deicide и Cannibal Corpse, которые дают совместно короткий тур. Далее состоялся двухнедельный мексиканский тур, а по возвращении Marduk играют на многочисленных летних фестивалях Европы. В этом году группа празднует юбилей - 10 лет с даты основания. В честь этого события группа играет на сцене родного Норркёпинга на Хэлловин. В последствии был выпущен концертный альбом "Infernal Eternal" с записью юбилейного выступления. В декабре Marduk записывают седьмой полноформатник "La Grande Danse Macabre".

В 2001 году Marduk вновь посещают студию, а 5 марта выходит "La Grande Danse Macabre", после чего группа отправляется в турне в поддержку нового опуса.

В декабре 2006 года и в январе 2007 года Marduk находятся в студии. В этот же период проходит замена ударника Эмиля Ларсом Бродерссоном. В феврале группа возвращается в Мексику, даёт там 3 концерта на местных фестивалях. В апреле музыканты посещают с концертами Россию и Украину, после чего сообщается о выходе десятого полноформатного альбома под названием "Rom 5:12", который должен стать самым великим альбомом группы. Летом Marduk выступает на таких фестивалях, как Sweden Rock Festival, Metaltown Festival и Waldrock Open Air. В августе музыканты едут покорять Австралию, а по возвращении домой они делают новый круг по Европе, ставя акцент на западных странах. Также этой осенью музыканты впервые вторгаются в балтийское пространство.

В рамках "The Vanitas 2007/2008 Tour" группа даёт 20 концертов, охватывая балканские страны. В конце-концов формация доехала до Македонии, Сербии, Румынии и Болгарии. В начале марта 2008 года Marduk принимает участие в одном из самых крупных фестивалей Европы - в Metal Mania, который проходит ежегодно в Катовице, Польша. После этой даты группа вновь возвращается в Южную Америку. В рамках этого тура формация выступает в Бразилии, Чили, Колумбии, Эквадоре и Венесуэле. В конце апреля были переизданы некоторые альбомы Marduk. Летом вновь начинается пора фестивалей: Marduk отмечаются на Hellfest (Франция), Metalcamp (Словения), Kaltenbach (Австрия), Allience Fest (Португалия) и Summer Breeze (Германия). В сентябре Marduk возвращается к своим верным мексиканским поклонникам. Конец 2008 года ознаменовался туром по Европе вместе с Morbid Angel.

Начало 2009 года началось с подготовки к записи нового альбома. В марте группа отправляется в северную часть Европы, а летом они традиционно участвуют в многочисленных фестивалях. Скопировано с Dark-World.ru. После этого Marduk отправляются в студию Endarker, где и проходит запись одиннадцатого полноформатного альбома под названием "Wormwood". В августе группа отправляется в США, где даёт три концерта в районе восточного побережья. Далее музыканты штурмуют Европу в рамках тура "Blitzkrieg", который состоял из 15-ти концертов и проходил в августе-сентябре 2009 года. 24 сентября выходит "Wormwood", после чего начинается новая эра турне, получившая название "Funeral Nation European tour". Тур состоял из 30-и шоу и длился с конца сентября по конец октября, он охватил западную и южную часть Европы. В ноябре-декабре Marduk возвращаются к берегам Северной Америки и проводят там тур "US Plague 2009".

"The Funeral Nation Tour Part 2" начинается в 2010 году вновь с европейского турне. На этот раз под прицел попали Балканы, а также Германия, Австрия, Бенилюкс, Ирландия и Великобритания. Турне завершилось в феврале и включило в себя 29 шоу. В апреле Marduk едут на север: группа участвует в шведском House of Metal Festival и в норвежском Inferno Festival. В мае группа гастролирует вместе с Deicide и Vader. Всё лето Marduk находилась в турне, посетив добрую половину земного шара. К концу года формация отправляется в азиатский тур "The Asian Black Death Redemption 2010", который охватил Китай, Таиланд, Сингапур и Индонезию.

2011 год начинается с североамериканских фестивалей. Также группа сделала короткий вояж по Центральной Америке, дав концерты в Гондурасе, Гватемале и Коста-Рике. Далее группа объединяется с Mayhem и Nifleheim для совместных концертов в Швеции. В марте осуществляется запись оркестра для нового мини-альбома, релиз которого запланирован на весну этого года. В это же время Marduk выступает хедлайнером на фестивалях Walpurgis Metal Days (Германия) и Puntopop (Бельгия).

В конце мая выходит трёхтрековый мини-альбом "Iron Dawn", после чего Marduk появляется в качестве хедлайнера на площадке Maryland Deathfest в США, это выступление стало первым в рамках нового тура "7 Bowls Of Wrath". Турне включает 7 шоу в семи городах США и Канады, оно длится до начала июня. Летом группа вновь хедлайнер всех самых знаменитых европейских фестивалях, что стало уже ежегодной традицией у наших брутальных шведов. В сентябре Marduk и Blooddawn Productions объявляют об окончании одиннадцатилетнего сотрудничества с Regain Records.