Группа Chthonian была сформирована в 1998 году в Финляндии как проект двух музыкантов: вокалиста/бас-гитариста Матиаса Лиллмонса и ударника Маркуса Розенберга. В скором времени на кассету было записано несколько песен, после чего деятельность проекта приостановилась на несколько лет.

Все эти годы бездействия дуэт вместе с гитаристом Йонасом Фрилундом играл в местных командах, оперирующей различной музыкой, начиная от хард-рока и заканчивая дэт-металом. В 2005 году все трое собрались вместе, чтобы возродить Chthonian и играть самый настоящий блэк-метал. Стоит заметить, что официально свое название группа приобрела только в 2005 году. Скопировано с Dark-World.ru.

Уже к весне 2006 года музыканты записали свое первое одноименное демо. Релиз получил положительные отзывы и привел к сделке с Woodcut Records. В сентябре того же года трио отправилось в студию KRS, где начало работу над дебютным альбомом под названием "Of Beatings And The Silence In Between". Его выход в свет состоялся 28 марта 2007 года все на том же Woodcut Records.

В 2009 году к парням присоединился второй гитарист Стаффан Холмняс, вместе с которым в следующем году был выпущен второй полноформатник "The Preachings Of Hate Are Lord". На данный момент потихоньку идет работа над третьим альбомом Chthonian.